この題を見て「おっ意外に高い」と思ったあなた
甘いです。非常に甘いです。
サラリーマンにはその5000円がそのまま手元にくることはありません。
まず、自給5000円というのは、残業の話であくまで私の会社でのことを前提にお話します。

日本人のサラリーマンが稼ぐお金は平均して約1000万〜1100万だといわれています。これは大卒したての新人から定年間際のお偉いさんまでの年収を人数で割ったら大体そのくらいになるということです。
そして、もしあなたの年収が500万だとしたら、会社はあなたに年収の約3倍。1500万の利益が必要なのです。
では、なぜ500万しか手元に残らないのでしょうか？

理由は大きく分けて3つあります。
1.それは厚生年金やら所得税、後は会社が吸い取っているからなのです。
2．あなたへの先行投資
あなたがもし入りたての新人ならば、入社して何ヶ月間ははっきりいってお荷物みたいなもので、それほど重要な仕事はまわってこないでしょう(できる人もいるけど)
そんな新人を支えるのはバリバリにプログラムを書いたりしている先輩達なのです。
別に「あなた達の分も仕事やってんだぞ」ってことを言いたいわけではありません。
新人が一人でも仕事ができるようになるまでの期間、つまり勉強期間にももちろん給与は支払われるのですから、会社はその分をストックしておかなければなりません。
3.実作業意外の仕事
あなたの会社がどこかのメーカーに雇われいたとして、あなたがバリバリにプログラムができたとしても、会社はそれだけではやっていけません。あなたの給料を計算する人、あなたの仕事を取ってくる人等、会社にはさまざまな役割の人がいるはずです。
そんな人達は雇ってくれるメーカーから1人当たりの給料が支払われるわけではないので、実際はあなた一人の給料の何％かをそういった人達へ渡さなければなりません。

以上のような理由から会社が得る利益より3割ほどがあなたの手元へ給料として支払われるのです。よって、残業代が5000円だったとしてもあなたの手元へは1600円くらいが手に入るわけです。この3割というのをいつも心がけて働いてみるとよいでしょう。
ちなみに私の会社はメーカーに雇われているので新人レベルですと、一月70万ほどで雇われています。年齢にもよりますが、33歳くらいの係長であれば150万くらいです。
大体、係長クラスになってくると3割ではなく2割から2．5割くらいしか手元に残りません。(上になればなるほどキビシー)
ここ最近は低迷しましたが、近年は派遣社員なるものがブームとなっていました。

派遣社員の場合ですと、働いている人の給料はそれほど変わりませんが、一般の会社よりも10万〜15万ほど安く人を雇うことができるようです。
なぜなら、派遣会社は自社員を登録しているだけで実際の仕事は派遣先でおこなっているため、もろもろの余分な出費が抑えられるためです。